Az anime 1. része a manga 1. fejezetét adaptálja, de vannak eltérések, a manga 1924-re helyezi a történetet, az anime 1928-ra.

A mangában mutatják a hajón történt események előzményét, illetve a telefonhíváskor nem Rosette alszik, mint az animében, hanem Chrno. Az animében a telefonhívástól kezdve addig, hogy megérkeznek a hajóhoz, filler. A hajónál Rosette összetöri az autót, úgy, mint az animében az első küldetés helyén. Az aranyrakományt a mangában ketten találják meg, az animében Rosette. A mangában Chrno keresztpajzsot tesz a hajóra, az animében nem. A mangában Chrno tudja, hogy nekimennek a szabadság-szobornak, az animében nem. A mangában a szörny beszél, és dolgoztatja legénység lelkét, az animében nem, a mangában el akarja venni Rosette lelkét, Rosette látja az emlékeit, az animében nem. A mangában Rosette lazít a pecséten, hogy Chrno hazaküldje a démont, az animében nem. A mangában a küldetés után még beszél Kate nővérrel, az animében nem.

A 2. rész az 1. fejezetben levő szöveggel kezdődik, de a 2. fejezetet adaptálja. Rosette rémálma és a templomos jelenet csak az animében van. A mangában ekkor érkezik vissza Remington tiszteletes, az animében már az első részben is szerepelt. A mangában Kate nővér ekkor szidja le Rosettet az eddigi hibáiért, az animében megdicséri. A küldetés, ahova hívják őket, nincs a mangában, ahogy a rész végén látható Joshua sem, Rosette a mangában nem veszti el fegyverét, Aion sem szerepel még, és az öreg sem csinál tölténykeresőt. Az animében küldik Rosettel az új töltényt Kate nővérnek, a mangában viszont a műhelyből viszi el. A mangában a lőtéren próbálja ki a töltényt, és abból jön elő a 2. rész ellensége, rögtön a végső alakjában, amin a mangában arcok, az animében szemek vannak. Az a rész sincs a mangában, hogy bárki megtámadná a rendet. Az animében Remington egyedül győzi le a démont, a mangában mindenki egyszerre lő. A fejezet végén Rosette és Chrno büntetésbe kerül, az animében nem. A rész vége a 14. fejezet 4-15. oldalát tartalmazza.

A 3. rész a manga 3-4. fejezetét adaptálja. A rész a 4. fejezet elején levő jelenettel kezdődik, illetve azzal, hogy kifigyelik Azmariát, ami a mangában később van. Az animében ekkor Chrno megismeri a démont, a mangában a démon látja meg először őt, és emlékszik vissza, hogy a múltban mit tett. A fatimai jövendölések részletesebben vannak az animében, mint a mangában, illetve Fatima a mangában Azmaria álmában van, az animében Remington beszél róla. A 3. fejezet elején van a kaszinós jelenet, ahol Rossete összetör egy játékgépet, a mangában (és az előző rész végén levő előzetesben) direkt, az animében viszont véletlenül. A rész első felében több fanservice jelenet van Rosette ruhájával kapcsolatban, holott a mangában nincsenek. A mangában Azmaria egy szennyeshordóba megy szökése után Rosettel együtt, míg az animében a személyzeti szobába. Az animében már a tetőn lelövi Rosette a vízköpők szárnyát, a mangában csak a kaszinóban. Remington nem mondja el a mangában Rosettenek, hogy Joshua apostol. A mangában Chrno kidobja Rosettet az ablakon, hogy felébressze, az animéből az ébredés jelenete hiányzik. Az animében Azmaria kakaót iszik, amikor elsírja magát, a mangában nem iszik.

A 4. rész a manga 5-6. fejezetét adaptálja. A mangában Chrno használja az órát, hogy megmentse Rosettet, és begyógyítsa sérüléseit, az animében nem. A mangában mutatják a lángoló helyet, ahonnan elmenekültek, az animében nem. A három apáca nincs a mangában. A mangában a feleségének lelkét akarja visszazárni a testébe Azmaira hangjával, az animében a saját testét akarja helyreállítani. A mangában Rosette csak akkor nyitja fel a pecsétet, amikor Chrno a zeppelinen elkezd harcolni, az animében már a földön, és a zeppelinre Remington repülőgépével jutnak fel a mangában. A mangában ekkor beszél Remington a fatimai jóslatokról, melyek közül elmondja, hogy a harmadik egy angyal eljövetele, ami Azmaria, az animében ez nem történik meg. Leraije az animében beszél Azmariának Chrnoról, a mangában Chrno bezél róla Rosettenek. Leraije az animében megemlíti Aiont, a mangában nem. Leraije keze az animében fegyverré alakul, a mangában nem. Rosette a mangában Leraije jobb karját pusztítja el, és akkor törik el a receptor, az animében a receptort találja csak el. Rosette és Azmaria leesése a zeppelinből részletesebb az animében, mint a mangában. A mangábn Remington beszél Kate nővérnek az ember haláláról, amit az újságban olvas, az animében ez nincs benne.

Az 5. rész a manga 12-13. fejezetét adaptálta az utolsó négy oldal kivételével. A rész és a manga eleje eltér, itt már Rosette Joshua után akar menni a mangában, illetve nem is az udvaron találkoznak Azmariával. Az animében Kate nővér kérdezi Chrnót az előző küldetésről, a mangában nem, az animében beszélnek Aion tervéről, a mangában nem, illetve a mangában Rosette válaszol Kate nővérnek, az animében nem. A mangában Azmaria meglátja Joshua fényképét, az animében nem. A mangában Kate nővér szerint Azmaria olyanná is válhat, mint Mária Magdaléna, az animében ez nincs. A mangában Kate nővér elmegy a mosdóba az edzés elindítása előtt, az animében nincs megindokolva hol volt. Az animében Rosette vállalkozik, hogy megvédi Azmariát, a mangában csak lenn marad. Az animében szentelt vízzel is támad az Azmariát mágszállt démonra, a mangában nem, a mangában és az animében más irányból jön a démon. Az animében Remington a megváltóval példálózik, amíg Rosette merül Azmaria lelkébe, a mangában nem. Rosette Joshuát hozza példának Azmariának a mangában, az animében nem. Illetve amíg Rosette Azmaria lelkében van, az animében mutatják Chrnót is, a mangában nem. A mangában úgy tűnik el a démon, hogy Azmaria megfogja Rosette kezét, az animében nem. Az animében azt mondják a végén, hogy olyan, mintha látták volna Szűz Máriát, a mangában nem.

A 6. rész a 15-17. fejezetet adaptálta annak utolsó négy oldalát leszámítva. A mangában pontos időpont van az elején, az animében nincs. Az animében Kate nővér és Remington beszélnek a csempészekről, a mangában nem. Az animében Rosették először rossz helyre mennek, a mangában nem, így a szörny megjelenéséig filler van. Máshogy találkoznak Satellával a mangában és az animében, illetve a mangában Satellának először tetszik Chrno. Rosette a mangában arcon lövi Satellát, az animében nem. Rosette a mangában Satellával akarja kifizettetni az autójukat, amit összetört, az animében nem. A mangában emberek is vannak az utcán, az animében nincsenek. A mangában Rosette menti meg Azmariát, ezért ő kapja el a lábánál az egyik démon, az animében Chrno próbálja megmenteni, de Azmaria szentelt vizet önt rá, ekkor tudja meg Satella, hogy Chrno démon. A mangában Satella véletlenül rádönt egy épületet Rosettékre, akkor Chrno átváltozik, hogy megvédje őket, az animében Chrno nem változik át. Satella ekkor ismeri meg, hogy őt keresi, az animében csak utalás szintjén jelenik ez meg. Az animében hamarabb mutat Satella a kardjával Chrnóra, mint a mangában. A mangában Chrno olvas Satelláról, az animében Azmaria, és még azelőtt, hogy a csempészek még több démont engednének el, a mangában ez utána van. Az animében az, hogy Satella beszél a lakájával filler. A mangában a csempészek a démonról is szednek le pecsétet, az animében csak a ládáról. A mangában Azmaria egy rendőrautóban alszik, az animében nem alszik. A mangában Satella hívja el őket a parkba, az animében követik. Az animében csak Chrno megy el hot dogért, és nem beszél vele Satella, a mangában mind mennek, miközben Satella beszél velük.  A mangában csak Rosette labdázik a gyerekekkel, és közben elrabolják Azmariát, Satellát és Chrnót egy másik dimenzióba, ahonnan Rosette menti meg őket, és Satella nem tudja ott használni az ékkövét, az animében Azmaria is labdázik, és a démonok a parkban jelennek meg. Chrno ott megmenti Satellát a mangában, az animében is ekkor csak a parkban vannak. A mangában Satella nem menti meg Chrnót, míg az animében igen. A mangában a fáraó múmiája beszél, az animében nem, illetve az animében átváltozik, a mangában nem. A mangában Satella elmondja a szarvak fontosságát, és hogy Chrnót kereste, az animében nem. A mangában Chrno pusztítja el a fáraó múmiáját, az animében Rosette. A mangában Satella töpreng, hogy melyik Chrno igazi arca, az animéből ez kimaradt. Az animében megdicsérik Azmariát, a mangában nem.

A 7. rész filler.

A 8. rész a 8. fejezetet adaptálja és 18-20. fejezetek egy részét adaptálja. Az animében Azmaria nincs az autóban, illetve már a telefonálással kezdődik a manga története, és ott folytatódik, hogy Rosette megérkezik a pályaudvarra, a többi Rosettes rész filler. Illetve az is filler, amikor Azmaria eltöri Kate nővér csészéjét. A mangában Chrno is Rosettel megy a pályaudvarra, az animében nem. A mangában a harc ott véget ér, hogy Rosette nem találja el az ablakban Risellet, az animében nem. A mangában ekkor adja át Rosettenek a fényképet, az animében már csak amikor visszaérnek a rendbe. A 19. fejezetből az a rész van még az animében, amikor bemutatkozik, illetve Chrno megismeri. Tehát a rész közepétől az utolsó fél percig ezt kivéve filler.

A 9. rész a 9-10. fejezetet adaptálta a 10. fejezet utolsó 11 oldalát kivéve. A mangában Kate nővér Remingtonnal beszél a képről, animében az öreggel beszél. Az animében Azmaria és Rosettékkel megy, a mangában nem. A mangában csak leesnek a gödörbe, az animében a sok esés filler. A sírban a mangában csak Chrno és a koporsó van, az animében más is. A mangában Joshua éhes volt, az animébőlez kimaradt. A visszaemlékezésen, Kate nővér és Remington, Chrno és Rosette beszélgetésén kívül minden más filler. A mangában kereste Joshuát egy fiú, amikor elmentek Chrnohoz, az animéből ez kimaradt. A piknik, amelyen Chrno az asztrálfolyamról beszélt, utáni közös eseményeik csak az animében vannak.

A 10. rész a 10. fejezet utolsó 11 oldalát és a 11. fejezetet adaptálta. Az animében onnan is mutatnak részleteket, amikor Aion letépte Chrno szarvát, a mangában nem, illetve a mangában Chrno 100 démont ölt meg, az animében több százmilliót. Az animében Aion beszél a tervükről is, a mangában nem. A mangában Aionnak csak a madár alakját mutatják, az animében az eredeti alakjában adja Joshuának a szarvakat. A mangában Joshua visszaemlékezései azelőtt vannak, hogy kimegy az ajtón, az animében utána. Az animében Joshua ellöki Rosettet, mielőtt elveszti az önuralmát, a mangában nem. A mangában Rosette visszaemlékezik, mikor Chrno az asztrális erőről beszél, az animében nem. Rosette következő visszaemlékezései mások: az animében nincs az épület régen és most képe, az animében Joshua arca a régiről az akkorira változik, az utolsó pedig az, amikor Joshua azt mondja, Rosettenek nem kell orvosnak lennie, a mangában viszont a sír előtti mondatra emlékezik vissza. Az animében benne van az óraátadás, a mangában nincs. A mangában Chrno bocsánatot kér, amiért még nem sikerült megmenteni Joshuát, az animében nem. Az animében a Remington említése utáni rész filler. A mangában a 11. fejezet azzal fejeződik be, hogy Rosette el akarja indítani a megállított időt, és elindulni a nyomon.

A 11. rész filler.

A 12. rész bár megemlíti az indulást, és az engedélyt is megkapják Kate nővértől, valamint az eltűnt nyomozókat a 14. fejezetben említik, filler.

A 13. rész a 19. fejezet 6. oldalának végétől a 21. fejezet utolsó előtti oldaláig adaptálja a történetet. Az anime első 5 és fél perce filler, kivéve Rosette gondolatait. Rosette csak a csomagokkal segít az ismeretlen nőnek a mangában, az animében helyet ad neki, az animében Satellával a vonaton találkoznak, a mangában együtt mennek a vonathoz. Más indokkal megy az étkezőkocsiba Rosette. A mangában hosszabb a visszaemlékezés Risellere. Azmaria elesése nincs a mangában, az animéből pedig hiányzik, amikor Chrno visszakíséri a fiút az anyjához. A mangában Riselle először elveszi Rosette fegyverét és óráját, aztán beszélnek, az animében nem ekkor veszi el. Az animében Riselle azt mondja Joshuáról, hogy szenved, a mangában nem. A mangában Rosettet körbeveszik az utasok, amikor a nőre céloz, az animében nem. Az animében Chrno a tetőn keresztül megy a vagonba, a mangában az oldalsó ablakon. A mangában Satella megüti magát, és Azmaria bekötözi a fejét, az animében nem. A mangában Azmaria az énekével menti meg az embereket, az animében szentelt vízzel, ezután ő pihen a mangában, az animében nem. A mangában Rosette Azmariánál felejti az óráját, az animében nem. A manga 20. fejezetéből a 8. oldal fele, a 10. oldal és a 11. oldal fele hiányzik az animéből. A mangában Riselle csak lekapcsolja az utolsó vagont, az animében azt is lerobbantja. Az animében Riselle lelöki, majd elkapja Rosettet, a mangában nem. Az animében rövidebb a harc. A mangában Rosette néhányszor arra gondol, hogy egyedül van, az animében ezt Riselle mondja neki. A mangában mutatják, hogy Chrno kitöri az ajtót, és Satella megidéz egy ékkőszörnyet, az animében nem. Az animében Rosette hamarabb ráesik Satella szörnyére, mint a mangában, és itt szúrja le Risellet, a mangában még a vonat tetején lelövi. Az animében a vonat kisiklott, a mangában nem. Rosette a mangában kérdéseket tesz fel magában, az animében nem. A rész utolsó fél perce is filler.

A 14. rész filler.

A 15. rész válogat a manga néhány történéséből és kiegészíti fillerekkel. A 22. fejezetben Chrno el akarja mesélni a múltját, de más körülmények között, mint az animében. A 23. fejezetben visszaemlékezik arra, hogy miért hívják bűnösöknek őket, illetve elmagyarázza a démonok kapcsolatait, az animében nem. A mangában mutatják a démonok következő nemzedékének pusztulását, amiért Aion levágta Pandemonium fejét, az animében nem. Az animében részletesebben mutatják a bűnösöket, mint a mangában, illetve szerepel bennük egy démon, aki meg akarta állítani őket. A 26. fejezetben megjelenik a két másik bűnös, és Jenaijal itt kerül konfliktusba Fiore, viszont a mangában Aion erőszakosabban álltja meg Jenait. Az anime meg nem említett részei fillerek.

A 16. rész szintén összeválogatott a manga néhány részéből, jóval több fillerrel, mint az előző részben. A 28. fejezetben emlékezik először vissza Satella, hogy a nővérével mi történt. A 29. fejezetben lövi először fejbe Rosette Aiont, hatásuk megegyezik, azaz sem a mangában, sem az animében nem okoz kárt benne. A 35. fejezetben kerül sor hosszabb visszaemlékezésre, amikor Satella ismét a nővéréről beszél. A nem említett részek fillerek.

A 17. rész filler, de van benne egy 3 és féloldalas rész a 26. fejezetből, ami az anime utolsó perce, de persze itt is eltérnek a körülmények. Aion és Joshua párbeszéde ugyanaz.

A 18. rész a 27. fejezetet teljesen és a 28. fejezetet a 11. oldaltól adaptálja. Az animében teljesen más körülmények között kerülnek a karneválra Rosették, mint a mangában. Máshogy és más miatt küldik pihenni őket a mangában és az animében. Az anime első 8 és fél perce filler, az előbb említett dolgot kivéve. Az animében először Joshuáék indulását mutatják, aztán Rosettéket, a mangában fordítva. Aion csapatának indulásában is van különbség, az animében Shader beöltözik, és másokat is beöltöztet, míg ez a mangában nincs. A mangában Aion beszél Pandemonium pusztulásáról és az emberiség kihalásáról, az animében nem. Rosette több fegyverrel lő mérgében az animében a céllövöldében, a mangában csak eggyel, a mangában ekkor vitatkozik Satellával, az animében a fényképezés után. Az animében több dolog történik a vásárban, mint a mangában, és Rosette veszi a fagyit, a mangában Azmaria adja Rosettéknek a fagyit. A mangában Satella provokálja ki, hogy Rosette táncoljon, az animében Satellát felkérik táncolni, ezért táncol Rosette is. A mangában csak Rosette és Chrno táncolnak, az animében mindenki. Az animében vásári fotós készíti a képet, Rosettenek küldi el, és Satella szidja, a mangában Satella kér meg egy helyi újságnak fényképezőt, aki neki küldi el a képet. A mangában Rosette kommentálja az eseményeket, az animében nincs kommentálva. Az animében vannak, akik távolról nézik a karnevált, a mangában nincsenek. A mangában Azmaria tartja vissza Satellát Chrno és Rosette követésétől, az animében fordítva. Azmaria és Satella beszélgetése a mangában nincs. Rosette a mangában kommentálja Chrnót, amikor megy utána, az animében nem. Az animében többet mutatnak Chrno múltjából a visszaemlékezésnél, mint a mangában. A mangában Rosette és Chrno nem beszél a halálról, illetve Chrno megemlíti a mangában, hogy szeretne mondani Rosettnek egy régi történetet, az animében nem. A rész végéről hiányzik a mangában levő kommentár.

A 19. rész a 29-30. fejezeteket adaptálja és a 31. fejezetet a 3. oldalig. A mangában Rosettenek először sikerül rálőnie Aionra, és csak utána veszi el tőle Joshua a pisztolyt, és Satellláék azt a lövést hallják. Az animében nem történik meg a lövés, csak Satella elmegy italért, akkor érkezik meg Jenai, hogy elvigye Azmariát, és megöli Steinert, aki a mangában ott sincs. A mangában Viede veszi rá, hogy menjen vele Azmaria, és velük megy Satella is. A mangában Joshua ráfog egy pisztolyt Rosettere, az animében nem, és a mangában akkor kezd el lüktetni a szarva, amikor megérkezik Chrno, az animében azért, mert megerőltette magát. Az animében Shader is ott van a szerkezetével, a mangában nincs. Az animében Aion véghezviszi a vezeklési szertartást a géppel, amit Shader alkotott, a mangában ez nem létezik, ezért minden ehhez kapcsolódó jelenet filler. Az animében Chrno ébredése előtt rendeli el az öreg az evakuálást, a mangában utána. Az animében Satella egy kicsit hamarabb találkozik a nővérével, mint a mangában. A mangában Aion szándékosan kelti fel Chrnót, az animében véletlenül. Az animében rövidebb Chrno visszaemlékezése, mint a mangában. Remington tiszteletes a mangában eleve a városban van, az animében csak ott terem, mikor szükség van rá, és a mangában még ekkor sincs a harc színterén.

A 20. rész 2 oldalt adaptál a 32. fejezetből. Itt annyi eltérés van a manga és anime között, hogy arra nem térek ki, csak a hasonlóságokra. Remington itt is megjelenik, de nem a semmiből, mivel a mangában nem angyal, de Aiont támadja meg, nem Jenait. Illetve Satella megismeri testvérét, Fiorét az animében és a mangában is.

A 21. rész a 36. fejezetből 9 oldalt; a 38. fejezetből összesen 13 és fél oldalt, a 39. fejezetből 12 oldalt, a 40. fejezet címoldalát adaptál. Csak Chrno visszaemlékezése van a mangából, előtte és utána is filler van. Más a részletek sorrendje. Az animében, mikor Chrno betör a Magdaléna-rendbe, Remington támad rá, mert angyal, a mangában is, viszont ott még fiatalon. Az animében a találkozásukkor van Magdaléna visszaemlékezése arra, hogy került a rendhez, a mangában két fejezettel később. A mangában kétszer támadnak Chrnora, mielőtt elviszi Magdalénát, az animében csak egyszer. Az animében Chrno és Magdaléna beszélgetése hosszabb, és Magdaléna nem csúszik meg a sziklán a mangában. Az animében Aion letépi a saját szarvait, a mangában nem. Shader máshol rakja össze a zsebórát az animében és a mangában. Aion és Riselle kapcsolatából mutatnak egy kicsit az animében, a mangában nem. Aion az animében akkor is a szertartást akarta véghezvinni, a mangában akkor sem volt ez. Az animében máshonnan nézik a naplementét, és Magdaléna beszél Aionról is, a mangában nem. A mangában és az animében másért kellene megölnie Chrnonak Magdalénát. Az animében, amikor Chrno nem öli meg Magdalénát, Aion odamegy, és letépi a szarvát, a mangában többet harcolnak, és Aion megpróbálja megölni Magdalénát, és ő is súlyosan megsérül. Az animében benne van, ahogy Chrno lezárja Magdaléna koporsóját, a mangában nincs. Beszél Magdalénával Rosetteről az animében, a mangában nem.